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新冠病毒進(jìn)化研究有了新視角

2023年02月13日08:48 來(lái)源:科技日?qǐng)?bào)

科技日?qǐng)?bào)訊 (記者劉霞)美國(guó)和瑞士科學(xué)家在生物預(yù)印本網(wǎng)站(bioRxiv)提交論文稱,他們利用已經(jīng)公開(kāi)的數(shù)百萬(wàn)個(gè)新冠病毒的基因組序列,以前所未有的方式對(duì)其進(jìn)化情況開(kāi)展了研究,揭示了新冠病毒為了存活必須處于特定狀態(tài)且能耐受變化的基因位點(diǎn)。這一發(fā)現(xiàn)有助科學(xué)家開(kāi)發(fā)出靶向新冠病毒某些蛋白的新型藥物。

研究人員指出,通過(guò)監(jiān)測(cè)新冠病毒變異株的生長(zhǎng)情況,他們有可能識(shí)別出一些對(duì)病毒生長(zhǎng)有利的病毒核糖核酸(RNA)單個(gè)堿基字母的突變。這些堿基字母與構(gòu)成病毒基因主干的四個(gè)堿基有關(guān),但這些單字母突變只是所有可能出現(xiàn)突變的一小部分。

新冠病毒每個(gè)RNA單字母可能平均突變了15000次。數(shù)以百萬(wàn)計(jì)新冠病毒測(cè)序樣本為研究人員提供了評(píng)估這些自然實(shí)驗(yàn)結(jié)果的方法。

在最新研究中,美國(guó)弗雷德·哈欽森癌癥中心和瑞士巴塞爾大學(xué)研究人員使用數(shù)百萬(wàn)個(gè)已公開(kāi)的新冠病毒基因組序列,首先統(tǒng)計(jì)了已知所有單字母突變均為中性的位點(diǎn)發(fā)生突變的頻率,因?yàn)檫@不會(huì)導(dǎo)致蛋白質(zhì)序列發(fā)生任何變化,所以得到的結(jié)果會(huì)指出在不影響病毒適應(yīng)性的情況下,任何位點(diǎn)發(fā)生突變的頻率。然后,他們將每個(gè)位點(diǎn)觀察到的突變數(shù)量與預(yù)期數(shù)量進(jìn)行比較,并將結(jié)果映射到新冠病毒所有蛋白上,以揭示病毒要生存并傳播,哪些位點(diǎn)必須處于特定狀態(tài),哪些位點(diǎn)可以耐受變化。

研究人員稱,這一發(fā)現(xiàn)有助于科學(xué)家開(kāi)發(fā)出靶向新冠病毒某些蛋白的新型藥物,這些蛋白通常不易通過(guò)變異來(lái)逃避現(xiàn)有藥物的攻擊。

(責(zé)編:?jiǎn)虡I(yè)瓊、楊迪)


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